Nachtschattengewächse sind ins Gerede gekommen, da sie als schlecht verträglich gelten. Tatsächlich sind einige Nachtschattengewächse roh für jeden ungenießbar. Bekanntestes Beispiel sind Kartoffeln. Sie enthalten ungekocht Solanin, das in größeren Mengen giftig ist. Auch beim Kochen wird es nicht abgebaut, geht aber ins Kochwasser über, weshalb sie dieses nicht weiterverwenden sollten. Backen Sie das Nachtschattengewächs, sollten Sie grüne Stellen und Keime sorgfältig entfernen – sie enthalten besonders viel Solanin. Verwenden Sie am besten frische, geschälte Exemplare, dann ist der Solaningehalt am geringsten. Weitere roh giftige Nachtschattengewächse sind unreife Auberginen und Tomaten. Letztere sind nicht mit speziell gezüchteten grünen Tomaten zu verwechseln.

Für manche Menschen können auch gekochte und reife Nachtschattengewächse ungesund sein. Wer an entzündlichen Prozessen im Körper oder an Autoimmunerkrankungen leidet, sollte vorsichtig sein. Wissenschaftlichen Forschungen zufolge können Antinährstoffe in den Nachtschattengewächsen, sogenannte Lektine, verschlimmernd wirken. Ob und wie die Betroffenen reagieren, ist aber höchst individuell. Da sich Unverträglichkeiten mit einer erheblichen Verzögerung von mehreren Tagen bemerkbar machen können, werden Symptome oft nicht mit dem Essen in Zusammenhang gebracht. In diesem Fall kann ein Ernährungstagebuch aufschlussreich sein.